正文:

近日,一家成立仅6个月的AI生物技术初创公司Chai Discovery,发布了用于分子结构预测的新型多模态基础模型Chai-1,并附带了技术报告,其中对比了Chai-1与AlphaFold等模型的性能。Chai-1模型在蛋白质、小分子、DNA、RNA、共价修饰等分子结构预测任务中均达到SOTA(最先进技术水平)。

Chai Discovery的联合创始人兼CEO Joshua Meier表示,Chai的模型在测试的基准上表现更佳,成功率提升10%至20%。例如,在与AlphaFold相比的药物研发关键任务上,Chai的模型始终表现更好。Chai-1可通过Web界面免费使用,并可用于药物发现等商业应用。同时,团队还将模型权重和推理代码作为软件库发布,供非商业使用。

Chai-1是一种多模态基础模型,旨在直接从原始序列和化学输入预测生物聚合物结构。它遵循Abramson等人的架构,并添加了语言模型嵌入和约束特征等关键元素。Chai-1还可以通过实验约束提示,如表位图谱或交联质谱实验提供的约束,从而实现对困难结合复合物的更准确预测。

在基准测试中,Chai-1在PoseBusters基准集上评估蛋白质-配体相互作用,配体RMSD成功率达到了77%,与AlphaFold3的76%相当。在CASP15蛋白质单体结构预测集上的Cα LDDT为0.849(而ESM3-98B为0.801)。此外,Chai-1在低同源性评估集上对蛋白质多聚体的预测性能优于AlphaFold Multimer 2.3(AF2.3)。

在核酸结构预测方面,Chai-1在不依赖核酸MSA的情况下,使用界面Cα-LDDT评估,其表现与RosettaFold2NA相似。同时,Chai-1在RNA结构上的表现也与RoseTTAFold2NA产生了类似的结果。

Chai Discovery由来自OpenAI、Meta FAIR和Google X等领先AI和生物技术组织的先驱者组成,致力于推动AI在生物学研究中的应用。公司已完成近3000万美元的融资,投资方包括知名投资公司Thrive Capital和OpenAI。这笔资金将用于将AI技术应用于药物研发过程,以期加速新药的研发。

Chai-1的发布标志着分子结构预测领域的一个里程碑。凭借其SOTA性能、多模态功能以及可访问性,Chai-1有可能彻底改变药物发现和生物工程。Chai Discovery团队表示,他们将继续改进Chai-1并开发新的模型,以突破分子结构预测的极限。

[附:试用网址:https://lab.chaidiscovery.com/]

结语:

Chai-1的推出,不仅展示了AI技术在生物领域的巨大潜力,也为药物研发和生物工程领域带来了新的希望。随着AI技术的不断进步,我们有理由相信,未来将会有更多像Chai-1这样的创新成果问世,为人类健康事业做出更大贡献。


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